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个性化条目:内含子保留率分析
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====内含子保留率==== 脚本 /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/jiaoben/intron_ratio/intron_ratio.py ====分析背景及介绍==== 该分析首先是对gene进行定量,去掉fpkm小于1的gene,然后对gene中intron进行定量,计算fpkm。intron保留率的计算根据intron的fpkm比上该intron所在gene全部exon的reads计算的fpkm;在计算intron保留率的差异时,选择表达量差异在2倍以上,使用t检验,阈值一选择矫正后的p值小于0.05。 ====分析使用数据==== 原始数据或bam文件
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个性化条目/内含子保留率分析.txt
· 最后更改: 2023/11/02 09:05 由
fengjie
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