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个性化条目:ps1分析并绘制se图片
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===PSI分析并绘制 SE 图片=== 该项分析为基于 AS 可变剪切数据进行的个性化分析,使用的数据为 PSI,对于 ASE 来说, PSI 计算公式为: PSI=splice in/(splice in+splice out), 公式来源: [[https://www.jianshu.com/p/183a0c87a4ca]], 计算得到的 PSI 使用 R 包的单因素方差分析(客 户要求使用 anowa 进行方差分析,但 anowa 为 SPSS 商用软件的分析内容,说明中提到该分 析为单因素方差分析,即 one-way anova(方差分析的简称为 anova,F 检验),因无法使用 SPSS 软件,我们使用 R 包进行单因素方差分析。 [[https://zhidao.baidu.com/question/1899829616755087100.html https : //baike.baidu.com/item/%E6%96%B9%E5%B7%AE%E5%88%86%E6%9E%90/1502206?fromti tle=anova&fromid=680591&fr=aladdin)]] 采用上述原理计算 PSI 值,并进行单因素方差分析,使用 PSI 的 FDR 值标注是否是显著的 并结合原始结果中的 lncLevelDifference 的正负来标注上下调的信息。
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个性化条目/ps1分析并绘制se图片.txt
· 最后更改: 2023/03/21 07:47 由
fengjie
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