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关于qiime1与qiime2分析之间的功能预测差距非常大的原因
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qiime1和qiime2使用的物种注释数据库有差别,以ITS为例,qiime1的数据库使用的是UNITE_INSD_v8.2,qiime2使用的是官网提供的qza格式的数据库,是按照99%相似性聚类过的数据库unite_v8.2_99_ITS_classifier.qza,数据库在整理过程中去掉了一些冗余序列,导致部分物种缺失,由于fungild是按照物种映射到功能的,注释数据库中物种缺失导致某个功能无法匹配上。
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关于qiime1与qiime2分析之间的功能预测差距非常大的原因.txt
· 最后更改: 2023/06/16 03:04 由
mengyanliang
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