跳至内容
售后
用户工具
登录
站点工具
搜索
工具
显示页面
修订记录
反向链接
最近更改
媒体管理器
网站地图
登录
>
最近更改
媒体管理器
网站地图
您的足迹:
单因素方差绘图
编辑本页后请点击“保存”。请参阅
syntax
了解维基语法。只有在您能
改进
该页面的前提下才编辑它。如果您想尝试一些东西,请先到
playground
热身。
媒体文件
====== 单因素方差分组柱状图 ====== 1. 横向分组柱状图 2. 计算组内平均相对丰度 3. 按照平均相对丰度降序排列 4. 标注单因素方差显著性和p-value ====== 输入文件 ====== 测试路径:/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/anova 输入文件:asv_table.g10.relative.xls <code> Taxonomy Model1 Model2 Model3 Model5 Model7 Model8 Model9 Model10 Escherichia-Shigella 0.210501493 0.045747524 0.014777551 0.021930514 0.112665723 0.018524341 0.011947807 0.013834303 Lactobacillus 0.003589582 0 0.016716449 0 0 0.000340617 0.001755489 0 Bacteroides 0.070114762 0.064245664 0.056516271 0.546088141 0.044987685 0.300948488 0.167845727 0.441623434 Faecalibacterium 0.116910339 0.303725829 0.287900225 0.092202484 0.532306241 0.142142221 0.320704292 0.013493685 Prevotella 0.012498035 0.005371273 0.000366819 0.001834093 0.011318975 0.014201121 0.001257664 0.00217471 Ruminococcus_gnavus_group 0.011135566 0.005083058 0.005659488 0.002541529 0.003772992 0.025048472 0.005056857 0.002200912 Blautia 0.023161977 0.025231882 0.067363622 0.004559032 0.011292774 0.008332023 0.024157627 0.050699576 Bifidobacterium 0.005030656 0.002934549 0.011895404 0.001126657 0.007362574 0.002620133 0.007100561 0.001074255 Agathobacter 0.013362679 0.02027983 0.05866478 0.009589687 0.009196667 0.007362574 0.021092071 0.002017502 Streptococcus 0.002227113 0.000681235 0.006943353 0.023057171 0.000733637 0.000681235 0.00296075 0.000366819 Others 0.531467799 0.526699156 0.473196038 0.297070691 0.266362731 0.479798774 0.436121155 0.472514804 </code> 输入文件:分组信息novo.list <code> Model1 Model Model2 Model Model3 Model Model5 Model Model7 Model Model8 Model Model9 Model Model10 Model Model11 Model Model12 Model Model13 Model Model14 Model Model15 Model </code> ====== 运行脚本 ====== <code> /TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HUMANn3/software/conda/envs/R_env/bin/Rscript /TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/anova/ANOVA.R \ --data asv_table.g10.relative.xls \ --group novo.list \ --output pic_ceshi </code> ====== 结果展示 ====== {{:anova.png?900|}}
保存
预览
取消
编辑摘要
当您选择开始编辑本页,即寓示你同意将你贡献的内容按下列许可协议发布:
CC Attribution-Share Alike 4.0 International
单因素方差绘图.txt
· 最后更改: 2023/01/06 02:05 由
sunhongtao
页面工具
显示页面
修订记录
反向链接
回到顶部