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可变剪切
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======单样本可变剪切====== rMATs4.1 可以对单样本进行可变剪切分析 ===更改部分=== 去除参数 --b2(比较组合中另一个样本) 及 --cstat 0.05(剪切差异cutoff,用于差异剪接的零假设检验的截止值。默认值0.0001,表示0.01%的差异。valid: 0 <= cutoff < 1,不适用于配对统计模型—) 增加参数 --statoff: 跳过统计分析 ===脚本=== /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/AS/only_as.sh ===脚本使用=== <code> RNASeq-MATS.py --gtf genome.gtf --b1 sample1.bam -t paired --libType fr-unstranded --readLength 150 --od out_dir --tmp out_dir/tmp --statoff </code>
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可变剪切.txt
· 最后更改: 2023/11/08 02:14 由
yangdan
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