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售后流程优化 ^ 序号 | 适用产品 | 分析名称 | 分析内容 | 评估须知 | 开发时间 | 备注 | | 1 | 有参 | [[产品:mapman功能富集]] | 功能富集分析 | | 2022/09/01| 示例 | | 2 | 医口 | [[ercc矫正并差异分析]] | 差异分析 | | 2022/09/01 | 示例 | |3 |所有| [[bigWigMerge合并bigwig文件]]|文件合并| |20220926|示例| |4|有参|[[ssGSEA&GSVA]]|ssGSEA&GSVA||20220926| |5|有参|[[整理AS结果用于绘图]]|文本整理||20220926| |6|有参|[[MA_plot]]|绘图||20220926| |7|lncRNA|[[整理]]|富集结果整理||20220927| |8|所有|[[填写project.txt]]|样本名称;分组;比较组合;venn;coexpr_venn填写||20220927| |9|有参|[[PPI分析]]|在ppi结果中添加ppi_name||20220927| |10|有参|[[转录富集分析]]|整理转录本富集分析的go.xls,kegg.xls||20220927| |11|有参|[[SNP分析]]|SNP中vcf文件转maf文件||20220831| |12|有参|[[logo绘制]]|样品各碱基占比绘制logo图||20220831| |13|NC|[[asso]]|mRNA和miRNA关联分析||20220831| |14|甲基化|[[计算gene内甲基化水平]]|根据cx_report和bed文件计算gene内甲基化水平||20220930| | |15|有参|[[TMB肿瘤突变负荷分析]]|结合TCGA数据库中某个癌症数据进行TMB肿瘤突变负荷分析||20221230| |16|有参|[[MSI微卫星不稳定性]]|结合TCGA数据库中某个癌症数据进行MSI微卫星不稳分析||20221230| |17|chip|[[峰图绘制]]|绘制reads_across_gene图| |20230513| |18|WGBS|[[methylKit差异DMR分析]]|使用methylKit软件进行DMR分析| |20230513| |19|所有|[[ResFinder耐药基因数据库注释]]|ResFinder耐药基因数据库注释||20230912| |20|WGBS|[[统计bam中指定深度位点个数及占比]]|统计bam中指定深度位点个数及占比||20230829| |21|WGBS|[[对甲基化位点进行区域注释]]|对甲基化位点进行区域注释||20230829| |22|有参|[[对样本进行tsne、umap、pca、pcoa、nmds、plsda、oplsda分析]]|对样本进行tsne、umap、pca、pcoa、nmds、plsda、oplsda分析||20230912| |23|有参|[[引物定位及定量]]|对老师给定的引物定位出其扩增位置,对该位置进行定量||20231107| |24|有参|[[可变剪切]]|单样本可变剪切||20231108| |25|lnc|[[lnc分类]]|20231230| |26|chip|[[motif定位]]|20231230| |27|有参|[[hallmark gsea分析]]|20231230| |28|无参|[[gsea分析]]|20240112| |29|有参、无参|[[gsea多条通路图绘制]]|20240112| |30|有参|[[CDS.fa密码子频率统计]]|20240131| |31|有参|[[模式生物,多组别富集分析]]|20240508| |32|有参|[[山峦图]]|20240905| |33|有参、无参|[[TCSS 评分]]| | | |20240905| |34|无参|[[trinity-2.15.1版本升级]]|拼接软件Trinity升级| | |20240930| |35|有参、无参|[[cibersort线性回归分析,wilcox分析]]|针对cibersort结果,分析支持分组的重要细胞组分;wilcox分析查找组间主要差异的细胞组分| | |20240930| |36|circ|[[Circexplorer circRNA鉴定]]|circRNA鉴定| | |20240630| |37|宏转宏病毒|[[Krona图绘制]]|Krona图绘制| | |20241028| |39|circRNA鉴定和定量|[[CIRIquant]]| CIRIquant | | |20241231|
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