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======简介======
meta高级分析流程中，基于unigene的转移元件分析所使用的数据库版本过旧，需要及时更新。

已将流程中isfinder数据库更新至2023.01.06版本。

由于此数据库不提供下载，只能使用爬虫爬取数据库网址信息，此处整理补充了isfinder数据库更新方法。

======功能======
整理完善了isfinder数据库的更新方法

======数据库下载流程======
**1. 爬取数据库网址链接：**

第一步用来抓取每个插入序列的注释信息以及对应的网址链接。
<code>
/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HUMANn3/software/conda/envs/python3/bin/python  ISfiner.step1.py  step1
</code>
**2. 插入序列网址下载：**

第二步根据下载的所有插入序列的网址链接，对每个网页进行下载，并提取网页中的seq序列信息
<code>
/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HUMANn3/software/conda/envs/python3/bin/python ISfiner.step2_new.py step1.IS.ID.list outdir/
</code>
<code>
rm IS.database.tmp.fa
find outdir/ -type f -name 'IS*.seq.fa'|xargs -L 1 -I {} cat {} >> IS.database.tmp.fa
</code>
<code>
/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HUMANn3/software/conda/envs/python3/bin/python check.empty.py IS.database.tmp.fa IS.database.fa > check.list
</code>
**3. 爬取注释信息：**

第三步，由于第一步爬取的注释信息不符合我们流程需要，需要重构脚本抓取注释。
<code>
/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HUMANn3/software/conda/envs/python3/bin/python ISinfo.py list ./
</code>
这样我们就得到了数据库网址最新的插入序列以及注释信息。

完整脚本路径：
<code>
/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/MGEs-unigene/database/isfinder/method
</code>

编辑摘要

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