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有参医口qc部分align_region计数
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====有参医口QC部分align_region计数==== 该部分分析,是使用picard 软件CollectRnaSeqMetrics模块。 测试路径/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/test/picard 根据/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/test/picard/region.txt,结合igv,结论如下: 1、如果某个gene的exon是另一个intron,则判断exon,即exon优先,然后是intron,最后是intergenic的优先级。 2、如果reads一段mapping到exon一段mapping段intron,软件是base计数,计碱基的个数,即mapping到exon的部分归为exon,mapping到intron的部分归为intron。
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有参医口qc部分align_region计数.txt
· 最后更改: 2023/08/08 08:01 由
zhangxin
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