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疾病多组学_dna_mrna_联合分析
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======简介====== DNA和RNA数据联合分析 ======功能====== DNA和RNA数据联合分析 ======脚本使用====== **1. 配置文件:** <code> RNA差异基因列表; DNA四部过库合并注释结果; DNA的share注释结果; 示例脚本: python DNA_RNA_Ass.py --pwd /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/04.DISEASE/WES.X101SC22084253-Z01-J007.lianhefenxi_wes.20230214 --dnafile /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/04.Diease/WES.X101SC22084253-Z01-J007.lianhefenxi_wes.20230130/Advance/run_disease.job/Share/snp.indel.filter.ShareGene.PatientShare.NotInNormal.xls --filterDB /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/04.Diease/WES.X101SC22084253-Z01-J007.lianhefenxi_wes.20230130/Advance/run_disease.job/Merged_vcf/Filter/snp.indel.merged.freq.func.syn.deleterious.xls --compare Distal_vs_Perineal --mRNA_project_dir /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/04.DISEASE/WES.X101SC22084253-Z01-J007.lianhefenxi_wes.20230214/X101SC22084253-Z01-J007 --type mRNA --value q </code> 运行脚本: <code> /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/04.DISEASE/WES.X101SC22084253-Z01-J007.lianhefenxi_wes.20230214/DNA_RNA_Ass.sh sh刷脚本; 然后运行Ass_Distal_vs_Perineal.sh </code> ======交付结果====== 表格结果; 按照要求绘制图片; 示例路径: /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/04.DISEASE/WES.X101SC22084253-Z01-J007.lianhefenxi_wes.20230214
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