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突变特征分解
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======简介====== 目前流程将所有样本放在一起进行突变特征分析 ======功能====== 此分析可以将特征分解到每一个个体 ======数据准备====== maf文件Somatic_mutation_typeSplit.maf <code> #!/bin/bash export LD_LIBRARY_PATH=/PUBLIC/software/HUMAN/R-3.3.1/lib64/R/lib/:$LD_LIBRARY_PATH export PATH=/PUBLIC/software/HUMAN/R-3.3.1/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/PUBLIC/software/public/System/R-3.2.1/lib64/R/library:$LD_LIBRARY_PATH python ./runDecontructSigs.py \ -m 。/Somatic_mutation_typeSplit.maf \ -r b37 \ -d cosmic \ -o ./01.result \ 示例脚本： <code> /TJNAS01/AFS_RESEQ/Users/hongxiang/Afs_pipeline/module_test/04.DeconstrutSig/test_DeconstrutSig.sh </code>
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突变特征分解.txt
· 最后更改: 2024/03/25 09:52 由
hongxiang
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