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===== 合并组甲基化水平或CX_report =====

将同组的样本的甲基化水平或者CX_report进行合并

脚本路径：
  /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/merge_cx/merge.py
  
==== 参数设置 ====

usage: merge.py [-h] [-T TY] [-D INPUT_DIR] [-O OUTDIR] [-C CON] [-F FAI]
  merge cx or Identification
  optional arguments:
  -h, --help                                   show this help message and exit
  -T TY, --ty TY                               merge cx or ml
  -D INPUT_DIR, --input_dir INPUT_DIR          the cx_report or mC_Identification dir
  -O OUTDIR, --outdir OUTDIR                   the out dir
  -C CON, --con CON                            condition.xls
  -F FAI, --fai FAI                            fa.fai（只有mC_Identification需要fai）

==== 输入文件 ====

cx如释放路径中CX_report文件夹命名方式一致

mC_Identification 如结果文件中3.1中一致

condition.xls 如下所示

^smaple|group|
^WS10_1|WS10|
^WS10_2|WS10|
^WS10_3|WS10|
^GS10_1|GS10|
^GS10_2|GS10|
^GS10_3|GS10|

==== 输出 ====

在out dir下建立log ，log文件夹下有各组的脚本

group_ml.sh 本地跑即可
group_cx.sh 需投递

结果输出在 输入路径下的 cx 或 ml 路径下

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