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统计bam中指定深度位点个数及占比
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=====统计bam中各个测序深度下位点个数及占比===== /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/jiaoben/jiajihua/get_depth.py usage: get_depth.py [-h] [-B BAM] [-D DEPTH_FILE] [-S SAMPLE] [-N NOTICE] [-F FAI] [-O OUT] [-T TMP] get sample depth info optional arguments: -h, --help show this help message and exit -B BAM, --bam BAM the bam file -D DEPTH_FILE, --depth_file DEPTH_FILE the depth file -S SAMPLE, --sample SAMPLE the sample name -N NOTICE, --notice NOTICE the depth list,split by "," -F FAI, --fai FAI the fai file -O OUT, --out OUT the out dir -T TMP, --tmp TMP the tmp dir
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统计bam中指定深度位点个数及占比.txt
· 最后更改: 2023/10/16 05:08 由
zhangxin
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