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====== 简介 ====== BactDating的目标是对细菌系统发生树节点进行贝叶斯分析。通常需要同时进行分子钟速率和共祖速率的贝叶斯估计。其他特点包括根位置的推断、缺失采样日期和不同的进化模型分析。 ====== 用法 ====== <code> library(BactDating) tree=simcoaltree(1990:2010) plot(tree) ape::axisPhylo(backward=F) obsphy=simobsphy(tree) r=roottotip(obsphy,1990:2010) res=bactdate(obsphy,1990:2010) plot(res,'treeCI') </code> ====== 结果图片 ====== {{:roottotip.png?400|}}{{:treeci.png?400|}}
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· 最后更改: 2023/04/14 08:37 由
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