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======简介======
meta分析流程中，会遇到客户需求按分组绘制CARD双圈图。

此处整理补充了meta CARD分组双圈图分析思路。

======功能======
CARD分组双圈图分析。
======数据准备======
**1. unigene丰度文件准备：**

双圈图的作图文件为Unigenes.absolute.total.tax.xls和Unigenes.protein.rgi.txt，整体性思路是按照分组将2个表格处理成分组表格，
首先处理Unigenes.absolute.total.tax.xls将同一个分组的样本列提取出来，然后使用脚本处理该文件的行，脚本如下：
<code>
perl /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/META/CARD/fenzu-circos/shaixuan.pl Unigenes.absolute.total.tax.xls
</code>
此处挑选出分组unigene id形成一个list，命名为shaixuan.list。

**2. rgi预测文件准备：**

根据挑选出的unigene id list，即shaixuan.list对rgi文件进行筛选，选出该分组的rgi预测结果。
<code>
perl shaixuan2.pl Unigenes.protein.rgi.txt shaixuan.list Unigenes.protein.rgi-new.txt
</code>

======数据分析======
**1. 生成分组双圈图各层级绘图文件：**
<code>
perl /PUBLIC/software/MICRO/share/MetaGenome_pipeline/MetaGenome_pipeline_V5.1/lib/05.Function/lib/CARD/lib/mechanism.tax.pl --mech /PUBLIC/software/MICRO/share/MetaGenome_pipeline/MetaGenome_pipeline_V5.1/lib/05.Function/lib/CARD/lib/../database/ARO_Mechnism.list --anno Unigenes.protein.rgi.txt --table Unigenes.absolute.total.tax.xls  --outdir Mech_tax --prefix meta.tax
</code>
**2. 绘制双圈图：**
<code>
perl /PUBLIC/software/MICRO/share/MetaGenome_pipeline/MetaGenome_pipeline_V5.1/lib/05.Function/lib/CARD/lib/circos_overview4.0.pl  --table Mech_tax/meta.tax.p.xls
</code>

完整脚本路径：
<code>
/TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/META/CARD/fenzu-circos
</code>

编辑摘要

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