跳至内容
售后
用户工具
登录
站点工具
搜索
工具
显示页面
修订记录
反向链接
最近更改
媒体管理器
网站地图
登录
>
最近更改
媒体管理器
网站地图
您的足迹:
msi微卫星不稳定性
编辑本页后请点击“保存”。请参阅
syntax
了解维基语法。只有在您能
改进
该页面的前提下才编辑它。如果您想尝试一些东西，请先到
playground
热身。
媒体文件
====== 结合TCGA数据库中某个癌症数据进行MSI微卫星不稳分析 ====== ===== mRNA ===== ===== 脚本使用 ===== sh /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/liuyan/2022_Q4/MSI.sh 需要在run.sh内修改部分读入文件 第一步：与老师确定本次项目分析所用的数据studyId可展示cBioPortalData包中包含的数据 第二步：将脚本中id改为老师指定的数据编号，sh /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/liuyan/2022_Q4/MSI.sh =======结果展示============================================= MSI值绘制箱型图{{ :msi.pdf |}} =======参考资料============================================== 参考[[https://mp.weixin.qq.com/s/LpepTq8LeE7LGCxyIRs65Q]] TCGA的微卫星不稳定性数据获取和可视化 MSI分数默认阈值0.4，高于阈值为MSI-H，低于阈值为MSS(无明显的MSI出现) 某些癌症疾病中MSI-H > MSI > MSS预后
保存
预览
取消
编辑摘要
当您选择开始编辑本页，即寓示你同意将你贡献的内容按下列许可协议发布：
CC Attribution-Share Alike 4.0 International
msi微卫星不稳定性.txt
· 最后更改: 2023/01/05 08:21 由
liuyan
页面工具
显示页面
修订记录
反向链接
回到顶部
