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picrust2与picrust内容上的区别
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===== PICRUSt2功能预测为什么没有KEGG通路的level1-3的结果,即PICRUST2与PICRUST的内容上的区别 ===== 与PICRUSt相比,PICRUSt2数据库中的物种分类学多样性有所增加,其中种增加近5倍,基因组增加10倍。PICRUSt2支持基于多个基因家族数据库的预测,默认包括KEGG同源基因,KO直系同源物,和EC酶分类编号,MetaCyc途径的丰度;Pfam数据库等。相较于PICRUSt中的分类层级结果,PICRUSt2中删除了该部分的分析结果和生成脚本,更侧重于其他数据库的注释内容,属于官方操作结果,因此无分类层级。
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· 最后更改: 2022/12/08 02:37 由
mengyanliang
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