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======简介====== 使用多线程或并行化使用最大似然法构建进化树,输入文件为phy格式 ======功能====== 构建进化树。 ======数据准备====== 1 样本名称列表 例如: /TJPROJ6/CCX/Project/Population/X101SC22032953-Z01_kunming100RAD_why/04.pts/01.lianshe/group_id 2 群call 的vcf文件 例如: /TJPROJ6/CCX/Project/Population/X101SC22032953-Z01_kunming100RAD_why/03.snp/01.lianshe/04.filter/Var-dp2-miss0.1-maf0.05.vcf.gz ======数据分析====== 脚本示例 : /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/QunTiJinHua_afssale/RAxML_RandomizedAxeleratedMaximumLikelihood/RAxML_major.sh <code> /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hongxiang/05.AFS/FusionGenes/FusionGenes_crest/PC9_ER/PC9_ER.crest.annotate.sh </code>
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