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scaftig转移元件抗性基因未被数据库注释原因
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===== scaftig转移元件的结果中,有的基因被列出来,但是既没有在plasmid,也没有 intergron 及IS上面,那这个基因被列出来的原因是什么 ===== scaftig转移元件第一步是将宏基因组基因集与 CARD 数据库比对结果及基因预测后的 gff 文件,找到含有抗性基因的 scafitigs,第二步是将找到含有抗性基因的scafitigs 与转移元件数据库比对,挖掘在该scafitigs 上的转移元件信息。若该基因既没有在plasmid,也没有 intergron 及IS上面,说明该基因只是没注释到转移元件数据库,但是是含有抗性基因的scaftigs。
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scaftig转移元件抗性基因未被数据库注释原因.txt
· 最后更改: 2022/12/08 02:38 由
mengyanliang
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