跳至内容
售后
用户工具
登录
站点工具
搜索
工具
显示页面
修订记录
反向链接
最近更改
媒体管理器
网站地图
登录
>
最近更改
媒体管理器
网站地图
您的足迹:
sequenza纯度倍性
编辑本页后请点击“保存”。请参阅
syntax
了解维基语法。只有在您能
改进
该页面的前提下才编辑它。如果您想尝试一些东西,请先到
playground
热身。
媒体文件
======简介====== 癌症的肿瘤纯度和倍性分析,使用sequenza软件输入成对bam文件进行自动分析 ======功能====== 标准输出结果和组图 ======脚本使用====== **1. 配置文件以及环境:** <code> 一个三列的文件: 样本名 N_bam T_bam 例如: /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/sequenza/example2_pipeline/sequenza_config 加载环境 export PATH=/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/miniconda3/envs/R41/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/miniconda3/envs/R41/lib:$LD_LIBRARY_PATH </code> 示例脚本: <code> sh /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/sequenza/run.sh 配置文件绝对路径 输出路径 </code> ======参考文献和连接======
保存
预览
取消
编辑摘要
当您选择开始编辑本页,即寓示你同意将你贡献的内容按下列许可协议发布:
CC Attribution-Share Alike 4.0 International
sequenza纯度倍性.txt
· 最后更改: 2022/09/22 03:08 由
liangjifeng
页面工具
显示页面
修订记录
反向链接
回到顶部