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脚本路径 /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/script/spearman_correlation/spearman_heatmap_v1.R ---- 参数说明 usage: /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/script/spearman_correlation/spearman_heatmap_v1.R [--] [--help] [--opts OPTS] [--file1 FILE1] [--file2 FILE2] [--outdir OUTDIR] --file1 和 --file2 是老师提供要做相关性的两个表格,样本数量和名称得保持一致 <nowiki> 脚本中p<-a$p.value #这个是spearman相关性系数的p值 </nowiki> <nowiki> s <- a$estimate #这个是spearman相关性系数 </nowiki> 根据需要自己提取,p值和相关性系数也可以都要得,最后根据得到表格用heatmap包进行热图得绘制
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· 最后更改: 2023/06/29 03:11 由
wangshuai
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