跳至内容
售后
用户工具
登录
站点工具
搜索
工具
显示页面
修订记录
反向链接
最近更改
媒体管理器
网站地图
登录
>
最近更改
媒体管理器
网站地图
您的足迹:
tf注释
编辑本页后请点击“保存”。请参阅
syntax
了解维基语法。只有在您能
改进
该页面的前提下才编辑它。如果您想尝试一些东西,请先到
playground
热身。
媒体文件
===== TF注释 ===== 脚本路径: /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/TF/TF.py 动植物转录因子数据库路径: /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/TF/AnimalTFDB3 /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/TF/PlantTFDB 参数设置: # 需要比对的fa parser.add_argument('-F', '--fa', help='input fasta file', required=True) #可选折植物或动物转录因子注释数据库 parser.add_argument('-T', '--type', help='type of speceis Animal or Plant', required=True) # 输出结果路径 parser.add_argument('-O', '--outdir', help='output dir', required=True) **[[结果展示]]** ^gene_id|species|tf_family|protein_family|score|evalue| ^AVESA.00001b.r3.5Dg0002536|Phyllostachys heterocycla|C3H|C3H family protein|67|4.9e-69| ^AVESA.00001b.r3.6Ag0003127|Aegilops tauschii|WRKY|WRKY family protein|673|5.8e-109| ^AVESA.00001b.r3.4Cg0000978|Zoysia pacific|TALE|TALE family protein|326|3.0e-29| ^AVESA.00001b.r3.4Dg0003041|Oryza punctata|NF-YB|NF-YB family protein|1013|5.8E-12|
保存
预览
取消
编辑摘要
当您选择开始编辑本页,即寓示你同意将你贡献的内容按下列许可协议发布:
CC Attribution-Share Alike 4.0 International
tf注释.txt
· 最后更改: 2023/05/10 07:32 由
yangdan
页面工具
显示页面
修订记录
反向链接
回到顶部