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uniport亚细胞定位
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=====uniport亚细胞定位===== 1、通过uniport数据库下载已有的亚细胞定位信息,网址https://www.uniprot.org/,集群保存路径/TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/Subcellular_location/uniport,目前只有Homo_sapiens_94的比对结果,如果是其他版本,则需要重新与uniport_human_fa.dmnd比对,使用Homo_sapiens_Subcellular_location_anno.xls中的注释信息添加亚定位信息。如下图示例 {{zhangxin:uniport_subcellular_location:uniport_subcellular_location.png}} 2、/TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/Subcellular_location/Homo_sapiens_94中Homo_sapiens_94_result.zip,是给老师做的一个结果,可以参照;pie_plot脚本是绘制饼图的脚本,输入文件格式为Homo_sapiens_94_result.zip中summary.xls文件,分类是根据老师提供的图做的可作参考,并不是标准。 {{zhangxin:uniport_subcellular_location:subcellular_location.png}}
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· 最后更改: 2022/07/29 02:06 由
zhangxin
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