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=====wikipathways===== wikipathways 官网:https://www.wikipathways.org/index.php/WikiPathways ; 下载数据网址 https://wikipathways-data.toolforge.org/ ; 参考博客网址 https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/108079039 如需富集可在下载数据页面获取gmt文件。 可使用R包查看物种,(/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/miniconda/envs/R_3.6.0/bin/R), library(rWikiPathways) listOrganisms() 查看该网站,目前网站中物种如下: ^| Acetobacterium woodii | Anopheles gambiae | ^| Arabidopsis thaliana | Bacillus subtilis | ^| Beta vulgaris | Brassica napus | ^| Bos taurus | Caenorhabditis elegans | ^| Canis familiaris | Clostridium thermocellum | ^| Danio rerio | Daphnia magna | ^| Daphnia pulex | Drosophila melanogaster | ^| Escherichia coli | Equus caballus | ^| Gallus gallus | Glycine max | ^| Gibberella zeae | Homo sapiens | ^| Hordeum vulgare | Mus musculus | ^| Mycobacterium tuberculosis| Oryza sativa | ^| Ovis aries | Pan troglodytes | ^| Populus trichocarpa | Rattus norvegicus | ^| Saccharomyces cerevisiae | Solanum lycopersicum | ^| Sus scrofa | Vitis vinifera | ^| Xenopus tropicalis | Zea mays | ^| Plasmodium falciparum |
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· 最后更改: 2022/05/13 07:33 由
zhangxin
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