=====对样本进行tsne、umap、pca、pcoa、nmds、plsda、oplsda分析===== /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/jiaoben/zuotu/tsne_umap_pca_pcoa_nmds_plsda_oplsda_plot -h usage: /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/jiaoben/zuotu/tsne_umap_pca_pcoa_nmds_plsda_oplsda_plot [--] [--help] [--add] [--opts OPTS] [--fpkm FPKM] [--condition CONDITION] [--prefix PREFIX] [--type TYPE] flags: -h, --help show this help message and exit -a, --add add confidence interval optional arguments: -x, --opts OPTS RDS file containing argument values -f, --fpkm FPKM the fpkm file -c, --condition CONDITION the condition file -p, --prefix PREFIX the prefix of outfile -t, --type TYPE one of tsne umap pca pcoa nmds plsda or oplsda 使用不同的方法查看样本的重复情况,其中oplsda仅支持2组样本,其余方法支持多组样本。每组大于3样本支持加入置信区间,少于或者等于3个支持加圈。