^描述|分类|问题汇总时间段| ^[[PCA分析组内各点之间的连线是用的什么计算方式]]|QIIME1云平台|2022.9-11| ^[[OTUs.fasta文件中的OTU序列包含小写字母原因]]|QIIME1|2022.9-11| ^[[QIIME2分析中是否对序列聚类设定了阈值]]|QIIME2|2022.9-11| ^[[随机森林交叉验证结果中变量数选择与误差值间的关系]]|QIIME1/QIIME2|2022.9-11| ^[[PICRUST2与PICRUST内容上的区别]]|QIIME1/QIIME2|2022.9-11| ^[[Scaftig转移元件抗性基因未被数据库注释原因]]|META|2022.9-11| ^[[MGE、抗重金属抗性基因中None的分类都包括什么基因]]|META|2022.9-11| ^[[次级代谢产物基因簇分析的输入文件]]|单菌|2022.9-11| ^[[框架图结果文件中04.Genome_Function\*\Effector\Secondary_Metabolism\*.svg图片中的相似性百分比]]|单菌|2022.9-11| ^[[Indel突变位置信息中“InDel_reads_cov”和“total_reads_cov”的说明]]|单菌|2022.9-11| ^[[Indel中检测到插入序列的插入位置在两基因之间原因]]|单菌|2022.9-11| ^[[降噪qiime dada2 denoise-single中--p-trim-left参数及线程数]]|QIIME2|2022.12-2023.3| ^[[关于feature_table.tsv文件是如何生成]]|QIIME2|2022.12-2023.3| ^[[云平台中CCA/RDA的分析方法]]|QIIME2云平|2022.12-2023.3| ^[[关于QIIME1与QIIME2分析之间的功能预测差距非常大的原因]]|QIIME1|2022.12-2023.3| ^[[差异检验中CI是如何产生的]]|QIIME1/QIIME2|2022.12-2023.3| ^[[nmds标准交付与云平台交付结果不一致]]|QIIME1/QIIME2|2022.12-2023.3| ^[[关于云平台柱形图样本与分组top物种一致的解释]]|QIIME2云平台|2022.12-2023.3| ^[[扩增子测序结果中如何生成OTUs.tre文件]]|QIIME1|2022.12-2023.3| ^[[随机森林分析中训练集和测试集的箱型图结果如何查看]]|QIIME1/QIIME2|2022.12-2023.3| ^[[扩增子项目Metastat分析点中关于p值校正后得到q值的方法介绍]]|QIIME1/QIIME2|2022.12-2023.3| ^[[在KEGG注释过程中,对unigene进行的相关过滤操作]]|META|2022.12-2023.3| ^[[ANOSIM分析箱图的纵坐标表示什么]]|META|2022.12-2023.3| ^[[关于交付CARD数据中相关gene name在官网出现查不到现象]]|META|2022.12-2023.3| ^[[基于scafitigs的转移元件分析里refseq文件里的注释信息获得]]|META|2022.12-2023.3| ^[[unigene转移元件中isfinder中anno丰度表中相关]]|META|2022.12-2023.3| ^[[ARG-OAP流程相关参数]]|META|2022.12-2023.3| ^[[META云平台中两次metastat分析结果不一致的原因]]|META|2022.12-2023.3| ^[[ARDB数据库注释时使用的Diamond软件的版本]]|框架图|2022.12-2023.3| ^[[次级代谢产物(Secondary_Metabolism)是如何预测的]]|框架图|2022.12-2023.3| ^[[交付的结果中有的snp indel的变异位点发生在exonic区域的解释]]|框架图|2022.12-2023.3| ^[[在InDel分析结果的InDel_list中,mutation_type有hete和homo相关解释]]|重测序|2022.12-2023.3| ^[[关于SNP分析中变异类型可靠性的说明]]|重测序|2022.12-2023.3| ^[[关于结果文件*.cnv.avinput.variant_function中的Line4位置突变相关解答]]|重测序|2022.12-2023.3| ^[[*.filter.snp.vcf.gz,*.filter.indel.vcf.gz这两个文件过滤的标准]]|重测序|2022.12-2023.3| ^[[原始数据FastQC分析显示Sequence Duplication Levels不合格,是否正常]]|重测序|2022.12-2023.3| ^[[gc-depth中的深度是怎么算以及与平均的测序深度不一样相关]]|框架图|2023.4-6| ^[[QIIME降维分析相关]]|QIIME2|2023.4-6| ^[[Lefse分析相关问题-重复物种]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[mummer进行的SNP相关参数]]|框架图|2023.4-6| ^[[top100的属物种进化树,关于不同门的物种会首先聚在一起的解答]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[新流程质控相关]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[cgMLST树图中堆在一起的点是否表示样本同源性高]]|框架图|2023.4-6| ^[[旧流程重测序中VCF文件是基于哪一部分结果得出的]]|重测序|2023.4-6| ^[[组装参数以及最优的选择方法]]|框架图|2023.4-6| ^[[QIIME2去噪相关]]|QIIME2|2023.4-6| ^[[云平台进行CCA/RDA 分析,输出结果环境因子数变少]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[串联重复序列结果统计相关]]|框架图|2023.4-6| ^[[数据质控时,低质量值和质控详细解释]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[老师反馈16SV4的扩增子测序照理拼接后应该得到300bp相关]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[云平台中Alpha多样性指数的指数组间差异检验相关]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[稀释曲线坐标相关]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[扩增子注释门水平是未鉴定,但其他层级有明确注释]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[gff文件相关]]|META|2023.4-6| ^[[环境因子分析中的ENVfit筛选阈值]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[新流程去嵌合体]]|QIIME1/QIIME2|2023.4-6| ^[[待整理]]|重测序|2023.4-6| ^[[待整理]]|重测序|2023.4-6| ^[[待整理]]|重测序|2023.4-6| ^[[待整理]]|重测序|2023.4-6|