====== 两种情况质控 ======
  - 有下机路径，文件命名包含诺禾编号，如FKDO240072420-1A_16SV34，接下来以情况1替代
  - 客户直接提供数据，文件命名自定义，如SC120s.1，接下来以情况2替代
根据两种情况的质控方法分别如下：

====== 情况1 ======

=== （1）首先需要配置list，包含七列分别为：文库号、标签、下机路径、诺禾编号、扩增区间、项目批次、测序通道，七列缺一不可 ===
{{ :kappframework-huptgi_1_1_.png?600 |}}
其中第一列、第四列、第五列、第七列都能在路径或文件信息中找到，剩余三列可自定义，第二列要求不同的标签、都三列和第六列填写相同内容
填写完list后使用：
=== （2）生成toml文件 === 
<code>
''/TJPROJ7/GB_MICRO/PUBLIC/software/amplicon/python3/bin/python /TJPROJ13/GB_MICRO/USER/yangyuhong/script/qc_toml/tab2list.py list''
</code>
----
=== （3）在目录下mkdir log ===
 
 <code>
''/TJPROJ7/GB_MICRO/PUBLIC/software/amplicon/python3/bin/python /TJPROJ7/GB_MICRO/PUBLIC/source/amplicon/module/splitQualityControl -PJ qc.toml -OD ./ -SD ./log''
</code>
----
=== （4）将rawdata软链接到autoDemultiplex文件夹的最底层目录下 ===

----

=== （5）进入log目录 ===

<code>
''for i in $(ls qc*); do qsub -V -cwd -l vf=10G,p=2 -q meta_ass.q $i; done''
</code>
一键投递所有qc任务，结果在结果文件夹（项目批次id+扩增区间）下查看


====== 情况2 ======

=== （1）首先需要配置list，包含两列分别为：诺禾编号、扩增区间，两列缺一不可 === 

{{ :ka2.png?200 |}}

----
=== （2）生成toml文件 ===
 
<code>
''/TJPROJ7/GB_MICRO/PUBLIC/software/amplicon/python3/bin/python /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenlei/jiaoben/qc/bin/tab2list.py list''
</code>

----
=== （3）在目录下mkdir log ===
 
<code>''/TJPROJ7/GB_MICRO/PUBLIC/software/amplicon/python3/bin/python /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenlei/jiaoben/qc/bin/splitQualityControl  -PJ qc.toml -OD ./ -SD ./log''</code>

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=== （4）将rawdata软链接到autoDemultiplex文件夹扩增区间的最底层目录下 ===
 


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=== （5）进入log下执行toudi.sh,结果在结果文件夹（扩增区间）下查看 ===