=====无参SNP结果中0/1:117解读=====

以:分隔
前面为位点的基因型GT。\\
每个个体该位点的基因型和基因型质量值。0/1: heterozygous,携带REF和ALT位点各一份拷贝 1/1: homozygous ALT, 0/0: homozygous, ./.: black,未检到。\\

后面为位点的基因型质量值GQ。\\


GT:样品的基因型（genotype）。两个数字中间用’/'分 开，这两个数字表示双倍体的sample的基因型。0 表示样品中有ref的allele； 1 表示样品中variant的allele； 2表示有第二个variant的allele。所以：\\
0/0表示sample中该位点为纯合位点，和REF的碱基类型一致\\
0/1表示sample中该位点为杂合突变，有REF和ALT两个基因型（部分碱基和REF碱基类型一致，部分碱基和ALT碱基类型一致）\\
1/1表示sample中该位点为纯合突变，总体突变类型和ALT碱基类型一致\\
1/2表示sample中该位点为杂合突变，有ALT1和ALT2两个基因型（部分和ALT1碱基类型一致，部分和ALT2碱基类型一致）\\

GQ:基因型的质量值（Genotype Quality）。Phred格式（Phred_scaled）的质量值，表示在该位点该基因型存在的可能性；该值越高，则Genotype的可能性越大；计算方法：Phred值=-10log(1-P)，P为基因型存在的概率。（一般在final.snp.vcf文件中，该值为99，为99时，其可能性最大）