====== 简介 ======
BactDating的目标是对细菌系统发生树节点进行贝叶斯分析。通常需要同时进行分子钟速率和共祖速率的贝叶斯估计。其他特点包括根位置的推断、缺失采样日期和不同的进化模型分析。
====== 用法 ======
<code>
library(BactDating)
tree=simcoaltree(1990:2010)
plot(tree)
ape::axisPhylo(backward=F)
obsphy=simobsphy(tree)
r=roottotip(obsphy,1990:2010)
res=bactdate(obsphy,1990:2010)
plot(res,'treeCI')
</code> 
====== 结果图片 ======
{{:roottotip.png?400|}}{{:treeci.png?400|}}