======简介======
HPB流程原在NJ集群,现迁移至TJ集群,在迁移测试的过程中发现存在抓取结果不全的问题,现在对抓取结果脚本进行了重构。
======功能======
更新HPB抓取结果脚本
======数据准备======
**1. HPB分析的输入文件:**
宏基因流程过程文件Dataclean.total.list;各分析点文件venn.list,venng.list,ter.list,ternaryg.list
======数据分析======
**1. HPB分析脚本:**
perl /TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HPB_pepline_v2.0/bin/HPB_pipeline_v2.0.pl --infile Dataclean.total.list --shdir ./Shell --qopts="-q meta_ass.q" --coverage 75 --identity 90 --mismatch 1 --evalue 1e-20 --cover_ARG 40 --group group --top 30 --notrun --rinfo r.info --lefse lefse.list --venn venn.list --venng venng.list --ternary ter.list --ternaryg ternaryg.list --vs vs.list --db ARDB
**2. 抓取结果脚本:**
perl /TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HPB_pepline_v2.0/lib/00.Commbin/get_result-cjw.pl --Group --indir /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/HPB-TEST --outdir /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/HPB-TEST/X101SC21102787-Z01-F013-B1-41_AHresult --shdir /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/HPB-TEST/Shell/detail/05.Getresult --db ARDB