======简介====== 建库测序数据需要进行排污处理,由于之前开发时只针对动植物的数据,NT数据库中缺乏微生物部分的数据,会造成排污遗漏,影响数据的准确性,为优化这一问题,现在更新使用NT全库进行比对。 ======功能====== NT排污 ======脚本使用====== **1. 数据库路径:** /TJNAS01/AFS_RESEQ/Share/NT_db/nt 示例脚本: /TJNAS01/AFS_RESEQ/Users/hongxiang/Afs_pipeline/ngsreseq_afs_pipeline_v1.py NT_mapping \ --samplelist ./samplelist \ --outdir ./ ======参考文献和连接======
/TJNAS01/AFS_RESEQ/Share/NT_db/nt
/TJNAS01/AFS_RESEQ/Users/hongxiang/Afs_pipeline/ngsreseq_afs_pipeline_v1.py NT_mapping \ --samplelist ./samplelist \ --outdir ./