======picrust2可视化柱形图,热图,ttest显示详细功能名称======
现有流程中picrust2各可视化分析(柱形图,热图和ttest)均使用各功能代号进行绘图,有客户要求使用description :function这种形式进行展示
现修改了流程步骤以实现需求如下:
======准备工作======
**1. 移动到主分析路径:**
cd 重分析主目录下
======运行步骤======
**1. 备份picrust2分析原表格+生成功能名称改动后的表格:**
sh /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/qiime2-new/picrust2/detail/beifen.sh
**2. 备份原分析log文件+生成新log:**
sh /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/qiime2-new/picrust2/detail/job.sh
注:需要将job.sh中的分期号,替换为该次分析的分期号
**3. 重新投递重分析的job:**
cd /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/X101SC21061533-Z01/X101SC21061533-Z01-F010/picrust2-20240426/log
SOFT=/PUBLIC/software/public
export LD_LIBRARY_PATH=$SOFT/System/pcre/lib:$SOFT/System/boost_1_55_0/lib:/opt/gridengine/lib/lx-amd64:/opt/openmpi/lib
/PUBLIC/software/public/System/sjm-1.2.0/bin/sjm X101SC21061533-Z01-F010_Analysis.job
**4. 对于KO层级ttest的特殊处理:**
注:由于KO 的ttest名称不全,属于特殊情况,需要等待上述三步跑完之后,最后处理该部分,
具体方法:需要将functionPrediction/picrust2/KO_metagenome_out/tables/sample/picrust2.sample.KO.relative.xls中分号改逗号,再重新分析该步
流程测试路径:
/TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/X101SC21061533-Z01/X101SC21061533-Z01-F010/picrust2-20240426