======简介======
癌症的肿瘤纯度和倍性分析，使用sequenza软件输入成对bam文件进行自动分析

======功能======
标准输出结果和组图
======脚本使用======
**1. 配置文件以及环境：**
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一个三列的文件： 样本名  N_bam  T_bam
例如： /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/sequenza/example2_pipeline/sequenza_config
加载环境 
export PATH=/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/miniconda3/envs/R41/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/miniconda3/envs/R41/lib:$LD_LIBRARY_PATH

</code>
示例脚本：
<code>
sh  /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/sequenza/run.sh     配置文件绝对路径     输出路径
</code>

======参考文献和连接======