====== 通过snp序列获得snp距离矩阵 ======
===== 一、需求说明 =====
如题所示

===== 二、实现方式 =====
1.首先通过snp_matrix2mfa.pl脚本将各个样本的snp结果转换为fa格式的序列文件

{{::snp.png?400|}}

转化为

{{:snp.fa.png?400|}}

2.执行

/TJPROJ6/RNA_SH/software/conda/conda/envs/snp-dists_0_8/bin/snp-dists snp.mfa > distances.tab

获得snp距离矩阵

{{::snp_dist.png?400|}}

3.如需要获得下三角矩阵，可以使用路径下deal.py脚本

===== 三、测试路径 =====
<code>
/TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/Resistance_Sniffer/snp-dists_0_8
</code>