脚本路径
  /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/script/spearman_correlation/spearman_heatmap_v1.R


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参数说明

usage: /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/script/spearman_correlation/spearman_heatmap_v1.R [--] [--help] [--opts OPTS] [--file1 FILE1] [--file2 FILE2] [--outdir OUTDIR]

--file1 和 --file2 是老师提供要做相关性的两个表格，样本数量和名称得保持一致

<nowiki>
脚本中p<-a$p.value #这个是spearman相关性系数的p值
</nowiki>
 
<nowiki>
s <- a$estimate #这个是spearman相关性系数
</nowiki>

根据需要自己提取，p值和相关性系数也可以都要得，最后根据得到表格用heatmap包进行热图得绘制