======简介======
疾病STR分析

======功能======
分析疾病数据微卫星，得到vcf格式的结果；

======脚本使用======
**1. 配置文件：**
<code>
环境变量：source /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/new_bash_profile/0118/disease_bash_profile

配置脚本：
python /ifs/TJPROJ3/DISEASE/share/Disease/LobSTR/lobSTR.py --sampleID S1 --fq1 MSIH_1_N_MSIH_1_N_rawdata_L2_1.clean.fq	--fq2 MSIH_1_N_MSIH_1_N_rawdata_L2_2.clean.fq	--format fq	--out /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/06.gaoji/STR



</code>
运行脚本：
<code>
sh /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/06.gaoji/WES.X101SC21114747-Z01-J001.STR.20220406/STR/cmd.sh
sh 刷脚本；
进入样本文件夹sjm先投递lobSTR_GSC_210518_T.job
</code>

======交付结果======

vcf文件；
注释结果；



示例路径：
/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/06.gaoji/WES.X101SC21114747-Z01-J001.STR.20220406/STR/GSC_210518_T/lobSTR_GSC_210518_T/vcf