======简介======
单菌框架图SV结果中，客户想要根据SV变异结果位置，找到参考对应gff文件中覆盖的基因名称，找到样本对应gff文件中覆盖的基因名称
======功能======
写脚本处理SV结果文件，到参考的gff文件中获取覆盖的基因名称，添加到SV结果文件的最后一列，然后再到样本的gff文件中获取覆盖的基因名称，添加到SV结果文件的最后一列。
======数据准备======
**1. SV结果文件：**

06.Comparative_Genomics/SV/SV*/*.SV.xls
 
**2. 参考基因组gff文件：**

参考.gff

**3. 样本基因组gff文件：**

样本.gff

======数据分析======
**1. 参考gff覆盖基因：**

根据SV变异结果位置，找到参考对应gff文件中覆盖的基因名称，添加到SV结果中的最后一列，以逗号分隔输出
<code>
perl /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/danjun/gxh/SV-GFF-pipei/pipei.pl *.SV.xls 参考.gff
</code>
对生成的文件重命名
mv new-SV.xls *-new.xls

**2. 样本gff覆盖基因：**

根据SV变异结果位置，找到样本对应gff文件中覆盖的基因名称，添加到SV结果中的最后一列，以逗号分隔输出

<code>
perl /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/danjun/gxh/SV-GFF-pipei/pipei2.pl  *-new.xls 样本.gff
</code>
对生成的文件进行重命名
mv new-SV.xls *-new2.xls