当只有两个比较组时:

分析使用R的基础分析包stats自带函数完成,其中T-test检验使用t.test函数,wilcox秩和检验使用wilcox.test函数,注意这两个函数默认 情况下不支持对p值进行校正,结果中也只有p值。

当比较组超过2组时:

Alpha多样性指数差异分析的KW检验的事后多重比较使用Fisher's 检验,校正则使用p.adjust函数默认方法(p.adjust函数默认方法BH) 具体使用R包agricolae中的kruskal函数实现。