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简介

基因组数据可视化

功能

基因组数据可视化（深度，vaf值等数据）

脚本使用

1. 处理数据： 

生成输入文件：
/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/03.CANCER/WGS.X101SC23041592-Z01-J001.gaoji_huitu_karkaryoploteR.20230615/03.Result_X101SC23041592-Z01-J001_cancer/result/Mutation/SNP/Vcf/Clone1.depth

/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/03.CANCER/WGS.X101SC23041592-Z01-J001.gaoji_huitu_karkaryoploteR.20230615/03.Result_X101SC23041592-Z01-J001_cancer/result/Mutation/SNP/Vcf/Clone1.vaf





运行脚本：
<code>

/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/miaojia/shell/conda/meme/bin/Rscript kar.R
pdftoppm -png design.pdf design

交付结果

图片： /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/03.CANCER/WGS.X101SC23041592-Z01-J001.gaoji_huitu_karkaryoploteR.20230615/03.Result_X101SC23041592-Z01-J001_cancer/result/Mutation/SNP/Vcf/X101SC23041592-Z01-F002

示例路径： /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/03.CANCER/WGS.X101SC23041592-Z01-J001.gaoji_huitu_karkaryoploteR.20230615/03.Result_X101SC23041592-Z01-J001_cancer/result/Mutation/SNP/Vcf/