山脊图

取输入的几个富集结果的交集通路做图,根据基因ID获取对应的log2FoldChange,展示富集基因的上下调情况。

输入文件:富集结果和差异结果等。

测试路径:/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/sunjiaxue/scripts/ridgeline_plot_test

Rscript /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/sunjiaxue/scripts/ridgeline_plot \
 --type KEGG --term MppvsMpp_LBPK95A.all_KEGGenrich.xls,ControlvsMpp.all_KEGGenrich.xls \
 --das MppvsMpp_LBPK95A_deg_all.xls,ControlvsMpp_deg_all.xls \
 --compares MppvsMpp_LBPK95A,ControlvsMpp  --prefix ./tt