差异表达基因再CNV图上的展示

from 张志明 https://note.youdao.com/ynoteshare/index.html?id=23221dd0a5a523e149d1268a9ecdcb2f&type=note&_time=1671105322269

/PUBLIC/software/Cancer/zhangzhiming/erjunyida_pipeline/sunwei/dna_rna/cnv_label_gene.py

开始分析:

python /PUBLIC/software/Cancer/zhangzhiming/erjunyida_pipeline/sunwei/dna_rna/cnv_label_gene.py \
--cnv_ratio CNV的结果文件,.mpileup.gz_ratio.txt格式
--genelist 一个基因列表
--outdir 输出路径
--genome 参考基因组版本
--samplename 样本名

测试路径:

      /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/CNV_Deffgene