参数说明

脚本路径:/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/gtf/get_genefa.py
python /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/gtf/get_genefa.py --help
usage: get_genefa.py [-h] -G GTF -A FA -O OUTDIR -T TYPE
 
annotation script
 
optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -G GTF, --gtf GTF     gtf or gff
  -A FA, --fa FA        fa
  -O OUTDIR, --outdir OUTDIR
                        outdir
  -T TYPE, --type TYPE  gtf or gff
重要: 
参数 需要的文件网页上下载的参考基因组序列和注释,注释可以是gtf或者gff
    如果是gff --type 就填gff,gtf反之