目录

简介

HPB流程原在NJ集群，现迁移至TJ集群，在迁移测试的过程中发现存在抓取结果不全的问题，现在对抓取结果脚本进行了重构。

功能

更新HPB抓取结果脚本

数据准备

1. HPB分析的输入文件：

宏基因流程过程文件Dataclean.total.list；各分析点文件venn.list，venng.list，ter.list，ternaryg.list

数据分析

1. HPB分析脚本： 

perl /TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HPB_pepline_v2.0/bin/HPB_pipeline_v2.0.pl --infile Dataclean.total.list --shdir ./Shell --qopts="-q meta_ass.q" --coverage 75 --identity 90 --mismatch 1 --evalue 1e-20 --cover_ARG 40 --group group --top 30 --notrun --rinfo r.info  --lefse lefse.list --venn venn.list --venng venng.list --ternary ter.list --ternaryg ternaryg.list --vs vs.list --db ARDB

2. 抓取结果脚本： 

perl /TJPROJ1/META_ASS/script_Advanced_analysis/HPB_pepline_v2.0/lib/00.Commbin/get_result-cjw.pl  --Group --indir /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/HPB-TEST --outdir /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/HPB-TEST/X101SC21102787-Z01-F013-B1-41_AHresult --shdir /TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/HPB-TEST/Shell/detail/05.Getresult --db ARDB