qiime2流程的network，我们只交付了过滤前的边点文件，现有老师需求交付用于绘图的边点文件，且可以直接导入到Gephi软件中，现编写了相关脚本可以直接提取边点文件。

相关流程步骤如下：

1. 将首次分析的中间文件拷贝到当前目录(如果涉及大量样本，需要写脚本批量处理)

包括以下几个文件：

genus.network.dot           #绘图文件
genus.spearman.index.list   #边文件
genus.detail.xls            #点文件的前置文件

1. 生成边文件：

perl /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/qiime2-new/network/shaixuan.pl \
    genus.network.dot \          ###输入绘图文件
    genus.spearman.index.list \  ###输入原交付的边文件
    edge.xls \                   ###输出新生成的边文件
    node.ori.xls \               ###输出新生成的点文件前置文件
    total.xls                    ###输出正负边比例

2. 生成点文件：

perl /TJPROJ5/META_ASS/16s/chenjiawei/script/qiime2-new/network/node.pl \
    genus.detail.xls \  ###输入原点文件的前置文件
    node.ori.xls \      ###输入新生成的点文件前置文件
    node.xls            ###输出新生成的点文件

测试路径：

/TJPROJ7/META_ASS/16s/chenjiawei/X101SC22043097-Z01/X101SC22043097-Z01-J165/network-20240426