脚本路径

/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/script/spearman_correlation/spearman_heatmap_v1.R

---

参数说明

usage: /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wangshuai/script/spearman_correlation/spearman_heatmap_v1.R [–] [–help] [–opts OPTS] [–file1 FILE1] [–file2 FILE2] [–outdir OUTDIR]

–file1 和 –file2 是老师提供要做相关性的两个表格，样本数量和名称得保持一致

脚本中p<-a$p.value #这个是spearman相关性系数的p值

s <- a$estimate #这个是spearman相关性系数

根据需要自己提取，p值和相关性系数也可以都要得，最后根据得到表格用heatmap包进行热图得绘制