Tajima’s D是由日本研究员Fumio Tajima创建的群体基因检验统计数据，可以用于区分DNA序列是随机进化还是受到自然选择。大于0代表群体观测杂合度高于预期杂合度，稀有等位基因频率降低（群体收缩或者平衡选择），小于0说明群体观测杂合位点少于预期值，稀有等位基因频率增加（群体扩张或者低频选择）

群体基因检验统计，计算Tajima’D值

1 群体的vcf文件/ –gzvcf 压缩格式的群体vcf 文件

脚本示例 ： vcftools –vcf 20F.vcf –TajimaD 500000 –step 250000–out TajimaD

/TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/QunTiJinHua_afssale/TajimaD/TajimaD_major.sh

结果解读： 结果目前只输出统计结果表格：四列：

第一列：CHROM ，计算窗口所在染色体/scaffold，
第二列 ：BIN_START，窗口起始位置，
第三列 ：N_SNPS ,窗口中的SNP 个数，
第四列 ：TajimaD ，TajimaD计算结果。