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交叉工单方法共享

重测序 & 建库测序

1. rfam数据库比对

工单背景:small RNA建库测序项目,物种为黑腹果蝇,目前客户使用的是fastqc进行数据质控,结果显示有过多的重复序列,且rRNA占比过高。

辛苦对该批次数据进行rfam数据库比对,确认可比对的rna类型,以及在各个物种中所占的比例等信息。

交付:比对的rna类型表格以及比对的物种信息表格。

参考:

perl /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/hanyue/05.jiankucexu/2021/Rfam.X101SC21012977-Z02.20210427/bwt/sRNA_compose.pl -i CDK-FHV.clean.fa -o CDK-FHV

微生物

交叉工单方法共享.txt · 最后更改: 2023/07/05 02:02 由 fengjie