已有引物定位的脚本,但在实际处理工单的时候,老师一般要求对引物定位到序列进行定量。
1.整合引物定位及有参定量脚本
/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/primer/work.py
python /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/yangdan/new/gongdan/primer/work.py \ --primer primer.xls \ --fa genome.fa \ --gtf genome.gtf \ --bam bam_dir \ --out out dir \ --sample sample1,sample2,sample3