脚本路径:
/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/wanghongyu/script/consensus/get_consensus_work.sh
参数设置:
#第一个参数:vcf文件 #第二个参数:fa文件 #第三个参数:gene文件,包含chr start end gene_name四列 #第四个参数:需要提取的样本名 #第五个参数:输出路径
每个样本每个基因的fa
Scaffold00452:35365-41699
AAAAAACTGAGGTTGGTGACTGTGTTCACCAGCAACATCAAAGCACTCTCTCTCTCTCTC TCTCGTCTCTTGCTCAGCTTCTACCCAGTTCTCTCTCTGCATACAAACATATTAATTATC ATCATTCATTTCAAATTTTCAATTCACGCAATTGGATTTGAAATCTGAAATGATGCAGAG