0.suppfiles_circrna_description.xls解读
0.SuppFiles/circRNA_description.xls解读
对于circRNA_description.xls中含义可按readme理解
| 列名 | 说明 |
|---|---|
| CircRNA_ID | circRNA ID |
| Chr | circRNA所在染色体 |
| Start | circRNA所在染色体的起始位置 |
| End | circRNA所在染色体的终止位置 |
| Strand | circRNA的正负链信息 |
| full_length | circRNA全长 |
| spliced_length | circRNA剪切后的长度 |
| gene_id | 来源gene_id |
| feature | circRNA涉及外显子基因组定位 |
| samples | 样本名称 |
| junction_read | 连接处read数 |
| non_junction_read | 非连接处read数 |
| surce_gene_name | 来源gene_name |
| Gene_description | 来源gene的描述信息 |
| *readcount | 样本的readcount值 |
| *tpm | 样本的tpm值 |
| log2FoldChange | 比较组合的log2FoldChange |
| Pvalue | 比较组合的p值 |
| Padj | 比较组合的矫正后p值 |
| significant | 比较组合间差异是否显著 |
其中，feature列的信息来源于ciri软件分析结果中cirexon_start、cirexon_end的合并，即根据所有样本的结果，在cirexon的start和end的位置，在有overlap的情况下会合并。
0.suppfiles_circrna_description.xls解读.txt · 最后更改: 2022/08/29 08:52 由 zhangxin
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