APOE（载脂蛋白E）是一个与脂质代谢有关的重要基因，它在人体内主要负责脂质的运输和分布。APOE基因有三个常见的等位基因：ε2、ε3和ε4，不同的等位基因组合形成六种可能的基因型：ε2/ε2、ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4和ε4/ε4。

这些基因型与多种疾病的风险有关，特别是阿尔茨海默病（Alzheimer's disease）和心血管疾病。例如：

ε4等位基因：携带一个或两个ε4等位基因的人群患阿尔茨海默病的风险显著增加。ε4/ε4基因型的人风险最高。 ε2等位基因：ε2等位基因被认为具有一定的保护作用，可能降低患阿尔茨海默病的风险。 ε3等位基因：这是最常见的等位基因，通常被视为中性，不显著增加或减少疾病风险。 APOE分型的过程涉及基因检测，通常通过血液样本或唾液样本提取DNA，然后使用PCR（聚合酶链式反应）和测序技术鉴定APOE基因型。

了解APOE基因型可以帮助个人和医生评估某些疾病的风险，并采取适当的预防和干预措施。然而，APOE基因型只是众多影响疾病风险的因素之一，环境、生活方式和其他基因也起着重要作用。

检测样本APOE亚型

样本的vcf文件 /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hongxiang/05.AFS/APOE

1 示例路径

/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/hongxiang/05.AFS/APOE

2 分析脚本

python APOE.py M3.bcftools.snp.vcf.gz APOE.xls

samplename	APOE亚型	genotype
A4087349889	E3	e3/e3
A4087352136	E3	e2/e4
A4087442407	E2	e2/e3
A5022852911	E4	e3/e4
A5022852920	E3	e2/e4
A5022852924	E3	e3/e3
A5022852926	E3	e3/e3
A5022852965	E3	e3/e3
A5022852971	E3	e3/e3